Вторая часть «Пути Баки» начинается ровно с того места, где закончилась первая: Бакки Ханма, только что одолевший своего отца Юдзиро в подземной арене, сталкивается с новой, куда более масштабной угрозой. Мир боевых искусств содрогается от новости о том, что пятеро сильнейших смертников из американской тюрьмы «Кондемнэд» сбежали и прибыли в Японию. Каждый из них — ходячая катастрофа, одержимая идеей бросить вызов самому сильному бойцу на планете, которым теперь считается Бакки. В отличие от предыдущих соперников, эти противники не просто хотят драться — они жаждут убивать, используя грязные приемы, оружие и абсолютное отсутствие морали. Бакки приходится вступать в бой с такими монстрами, как Специя, способный выживать после любых травм, и Ян, чьи удары копьем не оставляют шансов. Параллельно раскрывается тайна происхождения силы самого Юдзиро Ханмы, а также появляется новый загадочный персонаж — Пикл, доисторический человек, найденный в вечной мерзлоте, чья мощь превосходит все известные законы физики.
Сюжет набирает обороты, когда в историю вмешивается тайная организация, собирающая сильнейших бойцов мира для участия в грандиозном турнире, где на кону стоит не просто титул, а само существование человечества. Бакки понимает, что его личная месть отцу — лишь малая часть глобального противостояния. Ему предстоит объединиться с бывшими врагами, включая своего заклятого соперника Ретсу Кайо, чтобы противостоять армии мутантов и генетически модифицированных воинов, созданных безумными учеными. Отношения с Кодзуэ Мацумото проходят через тяжелые испытания, когда девушка оказывается втянутой в опасные интриги. Кульминацией становится финальная битва, где Бакки вынужден применить запрещенную технику, переданную ему матерью, чтобы спасти Токио от разрушения. Вторая часть заканчивается мощным клиффхэнгером: Юдзиро, наблюдавший за всеми событиями со стороны, наконец решает лично вмешаться в ход истории, заявляя, что его сын еще не готов стать королем, и бросает ему новый, самый страшный вызов, который перевернет все представления о силе и наследии клана Ханма.
