Тихим летним утром семеро школьников из Одайбы получают странные сообщения на свои телефоны. Каждое из них — приглашение в мир, где время течет иначе, а реальность подчиняется воле цифрового кода. Таити Ягами, его сестра Харука, их друзья Джо Кидо, Сота Такеучи, Иззи Изуми, Мими Тачикава и Томми Такаиши одновременно исчезают из своих домов, оставляя лишь мерцающие пиксели на экранах. Они оказываются на бескрайнем белом пляже под неестественно фиолетовым небом, где воздух пахнет озоном и нагретой платой. Первая встреча с дигимонами происходит спонтанно и пугающе: из облака данных материализуются Агумон, Габумон, Биёмон, Палмон, Гомамон, Тентамон и Патамон. Эти существа не просто спутники — они ключи к выживанию. Мир вокруг начинает искажаться: деревья превращаются в бинарные коды, океан шипит, как статическое электричество, а в небе появляются трещины, сквозь которые видны обрывки других вселенных. Дети понимают, что их затянуло в цифровую аномалию, созданную слиянием древней программы и человеческих эмоций.
Параллельно в реальном мире родители и полиция сбиваются с ног, но поиски заходят в тупик — пропавшие не оставили следов ни в одной базе данных. Тем временем в Дигитальном мире нарастает угроза: древний вирус, известный как Миллениумон, пробуждается после тысячелетнего сна. Он не просто хочет уничтожить дигимонов — его цель стереть грань между цифрой и реальностью, превратив Землю в бесконечный сервер боли. Детям предстоит не только научиться управлять эволюцией своих партнеров, но и понять, почему именно их выбрал сам Хост-Компьютер. Каждый из них несет в себе фрагмент кода, способный либо исцелить мир, либо разрушить его окончательно. Первая битва с силами тьмы заканчивается трагедией: один из дигимонов жертвует собой, чтобы спасти группу, оставляя детей наедине с осознанием, что обратного пути нет. Пролог заканчивается тем, что небо над Одайбой покрывается рябью, словно экран старого телевизора, а на месте пропавших детей остаются лишь выжженные силуэты в форме дигивайсов.