Эй, президент Трап! — это школьная романтическая комедия, которая начинается с классического, но неожиданного поворота. Обычный старшеклассник по имени Такуми однажды случайно становится свидетелем того, как его одноклассница, а по совместительству президент студенческого совета, красавица и отличница Аой, переодевается в мужской костюм. Оказывается, что у Аой есть тайна: её семья владеет крупной корпорацией, и по настоянию отца девушка должна посещать престижную мужскую академию, чтобы в будущем унаследовать бизнес. Чтобы не раскрыть обман, Аой вынуждена вести двойную жизнь — днём она строгая и элегантная президент совета в женской школе, а вечером превращается в дерзкого и харизматичного парня в мужской. Такуми, который сам не лишён проблем с самооценкой и постоянно попадает в неловкие ситуации, оказывается единственным, кто знает её секрет. Теперь он вынужден помогать Аой сохранять маскировку, что приводит к бесконечной череде комичных ситуаций: от случайных прикосновений и неловких взглядов до попыток уйти от подозрений одноклассников и строгих учителей.
Постепенно их вынужденное партнёрство перерастает в нечто большее. Такуми начинает видеть в Аой не только надменную отличницу или дерзкого парня, а ранимую девушку, которая устала от лжи и давления семьи. Аой, в свою очередь, ценит в Такуми искренность и умение хранить тайны, чего ей так не хватает в мире интриг и бизнеса. Однако их отношениям мешают не только социальные роли, но и чувства других персонажей: лучший друг Такуми, который влюбляется в «парня» Аой, и соперница из студсовета, подозревающая неладное. С каждым днём держать маску становится всё сложнее, особенно когда на горизонте появляется школьный фестиваль, где Аой должна одновременно присутствовать и как президент совета, и как наследник корпорации. Смогут ли они сохранить секрет, не разрушив при этом свои зарождающиеся чувства, или правда вырвется наружу в самый неподходящий момент?